Released in 1989, Rabies is the fifth album by Skinny Puppy. The album is notable for the involvement of Al Jourgensen of Ministry fame and it’s “new sound” aspect: introducing guitars and a harder speed metal element towards the band’s sound. Upon it’s release, Rabies was a controversial album that divided the fanbase of the band. Part of the controversy stemmed from the fact that a post-production mix up resulted in initial pressings of the album having a muffled sound quality to the songs.

1990 год стал переломным в истории Skinny Puppy. Нивек Огр, Кевин Ки и Дуэйн Гёттел, утомленные интенсивной совместной работой последних лет, разбрелись по собственным сайд-проектам и другим группам. По словам Огра, участвуя в других проектах, он "получил шанс пообщаться со многими замечательными людьми и реализовать идеи, которые уже давно обдумывал". Огр записывался с группами Ministry, Revolting Cocks и Pigface, работал в новом проекте Welt, созданном бывшим басистом Killing Joke Рейвеном (Raven). Кевин и Дуэйн создали группу Hilt, написали саундтрек для фильма "Doubting Thomas".

В 1985 году Skinny Puppy расширились до трио: в группу пришел клавишник и программист Вильгельм Шрёдер (Wilhelm Schroeder). В октябре 85 года вместе с новым участником Skinny Puppy записали свой полноформатный дебют "Bites". Продюсерские обязанности легли на плечи Кевина Ки и Дэйва Огилви. Американская и канадская пресса приветствовала релиз достаточно доброжелательными рецензиями, а в независимых чартах диск "Bites" чувствовал себя более чем уверенно. Треки "The Choke" и "Assimilate" принимались на ура клубной публикой Северной Америки.

Back and Forth Series Two is a compilation album by industrial band Skinny Puppy. It consists of the entire Back and Forth release remixed from the original four-track tapes, including raw live recordings and studio rarities. There is an untitled improvisational piece that appears before "Smothered Hope (demo)", and lasts just over two minutes long. cEvin Key - keyboard, drumbox, tape, effekt, voice. Nivek Ogre - voice, lyrik. Guitar on K-9 by Greg Monk (uncredited).

Twelve Inch Anthology is a compilation album by Skinny Puppy. It contains most of the band's early singles and B-sides. The CD is currently out of print but still available for download. The cover design is a collage of previous Steven R Gilmore covers. Another B-side compilation was released in 1999 as B-Sides Collect complementing the tracks found here with the exception of "Serpents".